ttyp4:makoto@u  13:00:54/040413(/tmp)> ktrace sudo echo test
Password:

ttyp5:makoto@u  13:01:07/040413(/tmp)> kdump ktrace.out 
 15557 ktrace   EMUL  "netbsd"
 15557 ktrace   CALL  execve(0x7fffe418,0x7fffe8d0,0x7fffe8e0)
 15557 ktrace   NAMI  "/home/makoto/bin/sudo"
 15557 ktrace   RET   execve -1 errno 2 No such file or directory
 15557 ktrace   CALL  execve(0x7fffe418,0x7fffe8d0,0x7fffe8e0)
 15557 ktrace   NAMI  "/usr/pkg/bin/sudo"
 15557 ktrace   NAMI  "/usr/libexec/ld.elf_so"
ttyp5:makoto@u  13:01:12/040413(/tmp)> 

ここから先の表示は得られなかった。(正常終了した時にも、これだけ)。 他の機械での正常な場合と全く同じ。
ypbind の再起動で直った。

ipcs -s | grep www | perl -e 'while () {@a=split(/\s+/); print `ipcrm sem $a[1]`}
instead:
ipcs -s | grep www | awk '{print "ipcrm -s ",$2}' | sh

This fixes the first problem.
RSA server certificate CommonName (CN) 'hoge' does NOT match server name!?