amd の map を一部変更していて、 cvsweb.cgi の中の

$config = $ENV{'CVSWEB_CONFIG'} || '/usr/pkg/etc/httpd/cvsweb.conf';

で指定されている中の、

25-%CVSROOT = (
26-#        'Development' => '/usr/local/src/cvsrep',
27:         'misc' => '/a/j/public-repository',
28:         'tracking'        => '/a/j/tracking',
29-#    'HTML-files' => '/tmp/upload'
30-         );
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の先が有効になっていなかった。